Порядок исчисления и уплаты НДС определен Налоговым кодексом Российской Федерации (часть вторая, глава 21) и Методическими рекомендациями по применению главы 21 "Налог на добавленную стоимость" части второй НК РФ.

Круг налогоплательщиков НДС очень широк. В качестве плательщика выступают все организации (государственные и муниципальные предприятия, хозяйственные товарищества и общества, учреждения) независимо от форм собственности и ведомственной принадлежности, имеющие статус юридического лица, согласно законодательству РФ, и осуществляющие производственную и иную коммерческую деятельность. Филиалы, отделения и другие обособленные подразделения организаций (предприятий), находящихся на территории РФ, с 01.01.2001г. самостоятельными плательщиками не являются, а исполняют обязанности головной организации по уплате налогов по их месту нахождения. При условии осуществления производственной и иной коммерческой деятельности на территории РФ плательщиками НДС могут быть: предприятия с иностранными инвестициями; международные объединения и иностранные юридические лица.

В соответствии с НК РФ с 2001г. в число налогоплательщиков вошли индивидуальные предприниматели, которые теперь уравнены с организациями в отношении исчисления и уплаты НДС. Это позволяет производить вычеты по товарам и услугам, приобретенным у индивидуальных предпринимателей, при условии, что последние реализуют товары, облагаемые НДС.

Организация подлежит обязательной постановке на учет в налоговом органе в качестве налогоплательщика по месту нахождения организации и по месту нахождения каждого ее обособленного подразделения. Индивидуальные предприниматели подлежат обязательной постановке на учет в налоговых органах по месту жительства в качестве налогоплательщиков. Постановка на учет организаций и индивидуальных предпринимателей в качестве налогоплательщиков осуществляется налоговыми органами самостоятельно в течение 15 дней с момента их государственной регистрации на основании данных и сведений, сообщаемых налоговым органам органами, осуществляющими государственную регистрацию организаций, физических лиц, осуществляющих предпринимательскую деятельность без образования юридического лица, либо органами, выдающими лицензии, свидетельства или иные аналогичные документы частным детективам и частным охранникам, а также на основании данных, предоставляемых налогоплательщиками. Иностранные организации имеют право встать на учет в налоговых органах в качестве налогоплательщиков по месту нахождения своих постоянных представительств в Российской Федерации. Постановка на учет в качестве налогоплательщика осуществляется налоговым органом на основании письменного заявления иностранной организации.

Налоговый кодекс РФ вводит принципиально новое положение об освобождении налогоплательщика от исполнения обязанностей, связанных с исчислением и уплатой налога на добавленную стоимость. Освобождение не распространяется на организации и индивидуальных предпринимателей, реализующих подакцизные товары и подакцизное минеральное сырье. Не применяется оно также в отношении обязанностей, возникающих в связи с ввозом товаров на таможенную территорию Российской Федерации.