Однако если районная (городская) налоговая инспекция непосредственно контролирует полноту и своевремен­ность внесения налоговых платежей, правильность исчисления налогов, то межрегиональные инспекции МНС РФ решают эти задачи в большей степени путем реализации организационно-методических функ­ций.

На них возлагаются: организация работы, нижестоящих налоговых инспекций по осуществлению контроля за соблюдением законодательства о налогах, сборах и других платежах в бюджет; обобщение и анализ отчетов налоговых инспекций о проделанной работе, подготовка на их основе методических рекомендаций по совершенствованию практики налогового контроля; организация взаимодействия налоговых инспекций с другими правоохранительными органами по усилению контроля за соблюдением законодательства о налогах и других платежах; комплексные и тематические проверки нижестоящих налоговых инспекций; обобщение и внедрение в налоговую практику передового опыта; проведение мероприятий по профессиональной подго­товке и переподготовке кадров; осуществление мер по созданию информационных систем, автоматизирован­ных рабочих мест и других средств автоматизации и компьютеризации работ в налоговых органах;. коорди­нация работы по взаимодействию с районными (городскими) органами власти и управления по вопросам обеспечения инспекций МНС РФ служебными помещениями, транспортом, вычислительной техникой, другими материально-техническими средствами, а их работников — жильем, дошкольными и школьными учреждениями в порядке, установленном Правительст­вом Российской Федерации и исполнительными органами субъектов Российской Федерации.

Когда межрегиональные инспекции МНС РФ непос­редственно осуществляют контроль за плательщиками налогов, сборов и других платежей в бюджет, они пользуются теми же правомочиями, что и налоговые инспекции по районам в городах и в городах без районного деления. Основным структурным элементом межрегиональных инспекций МНС РФ являются отделы.

Отделы создаются в зависи­мости от направления деятельности и видов налогов, по которым они осуществляют контроль, имеются отделы по налогообложению доходов (прибыли) юри­дических лиц; отдел налогообло­жения агропромышленного комплекса, природных ре­сурсов и земельного налога; отдел налогообложения физических лиц; отдел косвенных налогов; отдел местных и прочих налогов и сборов.

Кроме этого, как и в любой другой управляющей структуре, в составе инспекций МНС РФ функционируют отделы кадров, контроля, финансового обеспечения, юридический, хозяйственный и другие.

Общность задач, стоящих перед структурными подразделениями по контролю за уплатой конкретных видов налогов и сборов, находит свое отражение в положениях о соответствующих отделах утверждаемых руководителями налоговых инспекций. В этих нормативных документах содержатся общие требования, определяющие место отдела в структуре налоговых инс­пекций, его полномочия, принципы организации рабо­ты, другие вопросы, входящие в компетенцию этого структурного подразделения. В положении, как правило, закрепляют­ся и пути решения поставленных задач, указывается, что сотрудники отдела проводят и организуют контроль инспекций МНС РФ по районам и городам без районного деления за уплатой конкретного налога или группы налогов, готовят обзорные письма и указания по применению законов и подзаконных актов; проводят документальные и камеральные провер­ки бухгалтерских отчетов и балансов юридических и физических лиц по выплате того или иного налога; рассматривают письма, заявления и жалобы на действия сотрудников инспекций МНС РФ района (горо­да) о нарушениях законодательства при изыскании конкретного налога. В отдельных случаях в положении указывается перечень видов налогов, которые контролируются тем или иным отделом. Так, в положении об отделе налогообложения физических лиц, как правило, называются: подоходный налог с доходов физических лиц (включая налогообложение доходов от предпринимательской деятельности); налог на имущество физических лиц; земельный налог; государственная пошлина; налог с имущества, переходящего в порядке наследования и дарения; налоги и платежи, устанавливаемые местными органами власти в части, касающейся физических лиц.

На основании положений об отделах разрабатывают­ся и утверждаются начальником инспекции МНС РФ функциональные и должностные обязанности сотрудников.

В соответствии с Положением о Министерстве Российской Федерации по налогам и сборам в Министерстве РФ по налогам и сборам образуется коллегия в составе Министра МНС РФ (председатель коллегии) его заместителей, входящих в неё по должности а также других руководителей структурных подразделений центрального аппарата Министерства и иных лиц. Члены коллегии, кроме лиц, входящих в неё по должности, утверждаются Правительством РФ по представлению Министра. На заседаниях коллегии рассматриваются основные вопросы, отнесенные к компетенции Министерства.